ขณะเดียวกัน มีการยุบเลิกจำนวน 3 กองทุน คือ กองทุนส่งเสริมการประกันภัยพิบัติ, กองทุนส่งเสริมเศรษฐกิจสร้างสรรค์, เงินทุนหมุนเวียนการพิมพ์หนังสือพจนานุกรมและเอกสารทางวิชาการ
ส่วนกองทุนที่ยังคงสถานะไว้ คือ กองทุนการป้องกันและปราบปรามการฟอกเงิน เนื่องจากยังมีความจำเป็นในการเป็นเครื่องมือและกลไกของรัฐตามแนวนโยบายของคณะรักษาความสงบแห่งชาติและรัฐบาล และคงสถานะกองทุนพัฒนาบทบาทสตรี ซึ่งอยู่ระหว่างการจัดตั้งกองทุนพัฒนาบทบาทสตรีใหม่ในสังกัดกรมการพัฒนาชุมชน ซึ่งเมื่อจัดตั้งกองทุนใหม่แล้วจะให้ถ่ายโอนภารกิจกองทุนฯ จากสำนักเลขาธิการนายกรัฐมนตรีไปรวมไว้ที่กรมการพัฒนาชุมชน
พร้อมกันนี้ ครม.ยังเห็นชอบการปรับลดวงเงินนำส่งเข้าคลังของกองทุนต่างๆ ที่มีสภาพคล่องส่วนเกิน จากเดิมที่เคยมีมติครม.ไว้เมื่อเดือน ม.ค.58 ว่ากองทุน 30 กองทุนที่มีสภาพคล่องส่วนเกินสูงต้องนำเงินส่งเข้าคลัง 32,708 ล้านบาท เพื่อที่คลังจะนำเงินในส่วนนี้ไปไว้ใช้ในการขับเคลื่อนยุทธศาสตร์สำคัญเพื่อการพัฒนาประเทศนั้น ล่าสุดได้ปรับลดลงมาเหลือ 28,081 ล้านบาท ทั้งนี้เพื่อไม่ให้สภาพคล่องของกองทุนตึงตัวจนเกินไป