นายสุเทพ เทือกสุบรรณ รองนายกรัฐมนตรี ระบุไม่เห็นด้วยกับแนวความคิดที่จะให้ออกกฎหมายนิรโทษกรรมกลุ่มผู้ก่อความไม่สงบในพื้นที่จังหวัดชายแดนภาคใต้ของ พล.อ.ชวลิต ยงใจยุทธ ประธานพรรคเพื่อไทย เนื่องจากเห็นว่าเป็นเรื่องที่เป็นไปไม่ได้ เพราะคนที่ทำร้ายผู้บริสุทธิ์จะต้องถูกลงโทษ เรื่องนี้ไม่ได้เป็นไปตามหลักการของการให้อภัย
ส่วนการจัดตั้งนครปัตตานีนั้นเป็นแนวคิดเดิมที่เคยมีการหยิบยกขึ้นมาพิจารณากันแล้วแต่ยังไม่ได้รับความเห็นชอบ และไม่น่าจะส่งผลกระทบต่อความร่วมมือกับรัฐบาลมาเลเซีย ซึ่งที่ผ่านมาได้สนับสนุนแนวทางการแก้ไขปัญหาของรัฐบาลชุดนี้มาโดยตลอด
นายสุเทพ กล่าวว่า ในฐานะที่ตนเองรับผิดชอบการแก้ไขปัญหาความไม่สงบในพื้นที่จังหวัดภาคใต้ ขอยืนยันว่ารัฐบาลจะไม่ไปเสียเวลากับเรื่องไร้สาระ เพราะแนวทางการแก้ปัญหาของรัฐบาลจะเร่งยกระดับคุณภาพชีวิตและความปลอดภัยของประชาชนในพื้นที่มากกว่าการใช้ความรุนแรง