ส่วนการจัดระเบียบแรงงานต่างด้าวนั้น มองว่าแรงงานที่มีปัญหาส่วนใหญ่จะแรงงานที่ผิดกฎหมาย ซึ่งการไหลกลับของแรงงานต่างด้าวที่เข้ามาอย่างผิดกฎหมายน่าจะส่งผลกระทบต่อภาคการเกษตร ภาคบริการ และประมง แต่ไม่ได้ส่งผลกระทบต่อแรงงานในภาคอุตสาหกรรมโรงงานที่ขึ้นทะเบียนถูกต้องตามกฎหมาย โดยขณะนี้ทาง คสช.ได้เดินหน้าประชาสัมพันธ์ ตลอดจนชี้แจงทำความเข้าใจต่อเนื่อง เชื่อว่าสถานการณ์ไหลกลับของแรงงานต่างด้าวจะคลี่คลายลงเร็วๆ นี้
อย่างไรก็ตาม ส.อ.ท. จะหารือร่วมกับภาครัฐเพื่อแก้ปัญหาแรงงานต่างด้าวที่ผิดกฎหมายให้ถูกกฎหมาย โดยหลีกเลี่ยงการผ่านกระบวนการนายหน้าหรือคนกลาง เพื่อแก้ปัญหาถูกเอารัดเอาเปรียบและหลอกลวงแรงงานต่างด้าวให้ได้รับความเป็นธรรม