ประกอบกับกรมเจ้าท่าได้มีข้อกำหนดว่า หากราคาน้ำมันดีเซลลดลงต่ำกว่า 21 บาท/ลิตร ให้ผู้ประกอบการเรือด่วนเจ้าพระยาปรับลดอัตราค่าโดยสารลง 1 บาท และผู้ประกอบการสามารถดำเนินการได้เมื่อราคาน้ำมันปรับลดลงเป็นเวลา 7 วันติดต่อกัน
ขณะที่ปัจจุบัน บริษัท เรือด่วนเจ้าพระยา คิดอัตราค่าโดยสารตามระยะทาง ดังนี้ เรือประจำทาง (ไม่มีธง) ราคา 9-13 บาท ,เรือด่วนพิเศษ (ธงส้ม) ราคา 14 บาท ตลอดสาย ,เรือด่วนพิเศษ (ธงเขียว) ราคา 13-32 บาท และเรือด่วนพิเศษ (ธงเหลือง) ราคา 19 บาท ตลอดสาย