พล.อ.ประยุทธ์ จันทร์โอชา นายกรัฐมนตรีและหัวหน้าคณะรักษาความสงบแห่งชาติ(คสช.) กล่าวถึงการตรวจสอบการใช้งบประมาณของสำนักงานกองทุนสนับสนุนและสร้างเสริมสุขภาพ(สสส.) ว่า เป็นการตรวจสอบของคณะกรรมการติดตามและตรวจสอบการใช้จ่ายงบประมาณภาครัฐ(คตร.) เพื่อยืนยันว่าเป็นการตรวจสอบทุกโครงการของรัฐ ป้องกันไม่ให้มีการกล่าวอ้างว่าไม่มีความเป็นธรรม
ทั้งนี้ยังอยู่ในระหว่างกระบวนการตรวจสอบ ยังไม่ได้ชี้ว่าผิดหรือถูก เนื่องจากข้อกฏหมายหรือระเบียบของกองทุนต่างๆ ที่กำหนดไว้ไม่ชัดเจน และการกำหนดขอบเขตการทำงานขององค์กรที่กว้างมากเกินไป ซึ่งแนวทางแก้ไขอาจจะต้องมีการร่างระเบียบการดำเนินงานขององค์กรขึ้นมาใหม่
ขณะเดียวกันการทำหน้าที่ของ สสส.จะหยุดไม่ได้เพราะจะส่งผลกระทบต่อประชาชนที่อาจได้รับความเดือดร้อน ซึ่งหากผลการตรวจสอบออกมาพบว่ากระทำผิดก็ต้องมีมาตรการลงโทษกับผู้บริหาร หรือปรับเปลี่ยนผู้บริหารภายในองค์กร และส่งศาลเพื่อดำเนินการเอาผิดต่อไป