โดยญี่ปุ่นจะช่วยทำการศึกษาและจัดทำข้อเสนอแนะในการพัฒนาภายใต้ยุทธศาสตร์การพัฒนาโครงสร้างพื้นฐานด้านคมนาคมไทย(ปี 58-65) และสำรวจความเป็นไปได้สำหรับความร่วมมือด้านวิชาการรวมถึงการถ่ายโอนความรู้ทางวิชาการด้านระบบขนส่งระบบราง
ทั้งสองฝ่ายจะร่วมมือกันในการศึกษาและวิจัยด้านการพัฒนาการขนส่งระบบราง เส้นทางกาญจนบุรี-กรุงเทพฯ, เส้นทางกรุงเทพฯ-ฉะเชิงเทรา-อรัญประเทศ และเส้นทางกรุงเทพฯ-ฉะเชิงเทรา-แหลมฉบัง เพื่อเป็นการพัฒนาการเชื่อมโยงโครงข่ายทางรางกับประเทศเพื่อนบ้านในเส้นทางแนวระเบียงเศรษฐกิจด้านใต้จากตะวันออกไปตะวันตก
นอกจากนี้ ญี่ปุ่นจะเริ่มศึกษาและให้ข้อเสนอแนะในการบริการขนส่งสินค้าทางรางเพื่อพัฒนาประสิทธิภาพการให้บริการขนส่งสินค้าทางรางของไทย
"ทั้งสองฝ่ายยินดีต่อความร่วมมือการพัฒนาระบบขนส่งมวลชนทางรางในเขตกรุงเทพฯ โดยโครงการรถไฟฟ้าสายสีม่วง และสายสีแดงถือเป็นความร่วมมือด้านระบบราง และหวังว่าจะได้รับเทคโนโลยีระบบราง และประสบการณ์ของญี่ปุ่นในโครงการระบบรางในเขตเมืองในอนาคต" พล.อ.อ.ประจิน กล่าว
ทั้งนี้ ทั้งสองฝ่ายจะจัดตั้งคณะกรรมการร่วมระดับรัฐมนตรีเพื่อกำกับดูแลการดำเนินงานตามบันทึกแสดงเจตจำนงนี้โดยคณะทำงานด้านระบบรางที่มีอยู่เดิมจะยังคงดำเนินงานเพื่อสนับสนุนคณะกรรมการร่วมระดับรัฐมนตรี