ทั้งนี้ คาดว่าจะมีผู้โดยสารเข้า/ออกประเทศเฉลี่ยประมาณปีละ 70 ล้านคน จะทำให้ กพท. มีรายได้จากการเก็บค่าธรรมเนียมการเข้าหรือออกประเทศ เพื่อเป็นค่าใช้จ่ายสำหรับการดำเนินงานและค่าภาระต่าง ๆ โดยจะเปิดรับฟังความคิดเห็นจากผู้ประกอบการสายการบิน และนำเสนอคณะกรรมการการบินพลเรือน (กบร.) พิจารณาให้ความเห็นชอบในการประชุมกบร. ครั้งต่อไป และคาดว่า กพท. จะเริ่มเก็บค่าธรรมเนียมฯ ดังกล่าว ประมาณปลายปี 2559
นอกจากนี้ยังอนุมัติร่างระเบียบคณะกรรมการกำกับสำนักงานการบินพลเรือนแห่งประเทศไทย ว่าด้วยการบริหารงานบุคคล พ.ศ. 2559 ซึ่งเป็นระเบียบที่เกี่ยวกับการบริหารงานบุคคลของ กพท. และอนุมัติกรอบวงเงินงบประมาณสำหรับใช้ในการดำเนินงานของ กพท. ในปีแรกเป็นเงินจำนวนประมาณ 796 ล้านบาท แบ่งออกเป็นงบบุคลากร จำนวนประมาณ 400 ล้านบาท ส่วนที่เหลือจะเป็นงบดำเนินการ และงบฝึกอบรม ทั้งนี้ กพท. ได้รับการจัดสรรงบประมาณประจำปี พ.ศ. 2559 จากกรมท่าอากาศยาน เป็นเงินจำนวนประมาณ 133 ล้านบาท